コンピューターで何らかの処理を行うためのファイル群。
プログラムをコンパイルしたもの（Javaであればクラスファイル）や、その実行に必要な各種ファイルを持つ。実行することで処理を行うことができる。
　
プログラムとの違いは、プログラムはコンパイル前のソースファイルに書かれた文章そのものを指すのに対し、アプリケーションはプログラムをコンパイルし実行できる状態にし、さらに実行に必要なファイルを含む点にある。
アプリケーションの中には、コンパイル前であるJSPやスクリプト等が含まれている場合もあるため、「コンパイル済み」ということは絶対条件ではないといえる。
　
ソフトウェアとの違いは、実際にはあまりない。
アプリケーションは比較的新しい言葉であり、規模が大きいものに使用されることが多い。
対して、ソフトウェアは古い言葉であり、規模が小さいものに使用されることが多い。特に実行ファイル1つだけ、という場合にはソフトウェアの方が良く使用される。
ソフトウェアは、以前の、OSという概念があまりない時代の言葉である。OSが広まったとき、OSを「基本ソフト」、OSの上で動くソフトウェアを「応用ソフト」と呼んで区別していたが、その「応用ソフト」の「応用」の英訳である「アプリケーション」だけが残ったものである。
　
Javaの場合、実行にはJREが必要であり単独で動かすことができないこともあり、「アプリケーション」という形で呼ばれることは少ない。
ただし、サーブレットやJSPによって動作するものは「Webアプリケーション」と呼ばれる。

「曖昧な言葉よね……」
「とゆーかJREそのものがアプリって感じだからなぁ」
「でもEclipseとかはアプリケーションって感じしない？」
「うーん……」
「？」
「……もしかして、パッケージとして売られてるものが、アプリケーションって感じするのかも」
「それはそうかも……」